樓宇自動化工程合同的跟蹤和控制要健全合同管理的工作制度（如文件的審批、簽字程序），完善合同文檔管理體系，提升合同管理人員素質，及時預見和防止合同問題。補充的技術協議及至工地會議紀要、工作聯系單等都應作為合同內容的一種延伸和解讀，必須妥善保存并便于查詢。同時注意有效證據應當是原件且與事實有關的、有蓋章（或簽名）的、有明確內容的保存。

樓宇自動化工程合同的跟蹤和控制要建立報告和行文制度。對在樓宇自動化工程中合同雙方的任何協商、意見、請示、指示都應落實在書面上，使樓宇自動化工程活動有依有據。一旦出現雙方爭議或糾紛，書面材料將是最有說服力的證據。